Кафедры
Кафедры института как учебно-научные и административные структурные подразделения осуществляют подготовку студентов по одной или нескольким родственным специальностям, повышение квалификации специалистов, а также руководство научно-исследовательской деятельностью кафедр.
На данный момент в структуре Башкирского кооперативного института (филиала) автономной некоммерческой образовательной организации высшего образования Центросоюза Российской Федерации "Российский университет кооперации" насчитывается 2 кафедры:
Кафедра гуманитарных и естественнонаучных дисциплин